VIH-1 : Génotypage de résistance sur ARN (reverse transcriptase + protéase + intégrase)
Synonymes : Mutation de résistance aux antirétroviraux, Reverse transcriptase, Protéase, Intégrase, HIVPathologies associées : VIH Date de mise à jour : 08/08/2023 - Fiche validée par : P. COULON
Vous travaillez dans un service de soins
Vous devez prélever :
- Sang : 2 tubes EDTA de 5 ml
- LCR : minimum 1 ml
Conditions de transport : Acheminement immédiat vers le laboratoire
Observations particulières :
- Préciser le traitement antirétroviral et le nom du prescripteur (si patient non suivi dans NADIS)
- Fournir le dernier résultat de la charge virale VIH-1 (< 1 mois, sinon sera réalisée et facturée en plus)
- Analyse réalisable uniquement pour une charge virale > 200 copies/mL.
- Le choix de la technique utilisée est dépendant de la valeur de la charge virale
VIH-1 : NGS pour les charges > 500 copies/mL,
Séquençage capillaire pour les charges comprises entre 200 et 500 copies/mL (et en cas d'échec avec la technique NGS)
- Pour toute demande sur LCR, la détermination du tropisme du VIH-1 est impérativement réalisée et facturée en plus.
Info CHU : Toute demande parvenant au laboratoire à partir du samedi 10 h jusqu'au dimanche midi ainsi que les jours fériés sera rejetée.
- Sang : 2 tubes EDTA de 5 ml
- LCR : minimum 1 ml
Conditions de transport : Acheminement immédiat vers le laboratoire
Observations particulières :
- Préciser le traitement antirétroviral et le nom du prescripteur (si patient non suivi dans NADIS)
- Fournir le dernier résultat de la charge virale VIH-1 (< 1 mois, sinon sera réalisée et facturée en plus)
- Analyse réalisable uniquement pour une charge virale > 200 copies/mL.
- Le choix de la technique utilisée est dépendant de la valeur de la charge virale
VIH-1 : NGS pour les charges > 500 copies/mL,
Séquençage capillaire pour les charges comprises entre 200 et 500 copies/mL (et en cas d'échec avec la technique NGS)
- Pour toute demande sur LCR, la détermination du tropisme du VIH-1 est impérativement réalisée et facturée en plus.
Info CHU : Toute demande parvenant au laboratoire à partir du samedi 10 h jusqu'au dimanche midi ainsi que les jours fériés sera rejetée.
Vous travaillez dans un laboratoire
Vous devez nous acheminer :
- Plasma (volume minimum 3 ml) : sang prélevé sur tubes EDTA puis centrifugé* et plasma aliquoté ou sang prélevé sur tubes EDTA-PPT puis centrifugé* dans les 24 h suivant le prélèvement.
- LCR : volume minimum 1 ml
*Conditions de centrifugation : 800 à 1600 g/min pendant 20 minutes à température ambiante
Conditions de transport : Acheminement du prélèvement (plasma/LCR) < à - 20° C
Observations particulières :
- Préciser le traitement antirétroviral et le nom du prescripteur (si patient non suivi dans NADIS)
- Fournir le dernier résultat de la charge virale VIH-1 (< 1 mois, sinon sera réalisée et facturée en plus)
- Analyse réalisable uniquement pour une charge virale > 200 copies/mL.
Le génotypage de résistance sera tenté pour les charges virales comprises entre 100 - 199 copies/mL, cependant le risque d'échec de séquençage est plus élevé.
- Le choix de la technique utilisée est dépendant de la valeur de la charge virale VIH-1 : NGS pour les charges > 500 copies/mL, Séquençage capillaire pour les charges comprises entre 200 et 500 copies/mL (et en cas d'échec avec la technique NGS)
- Pour toute demande sur LCR, la détermination du tropisme du VIH-1 est impérativement réalisée et facturée en plus.
- Plasma (volume minimum 3 ml) : sang prélevé sur tubes EDTA puis centrifugé* et plasma aliquoté ou sang prélevé sur tubes EDTA-PPT puis centrifugé* dans les 24 h suivant le prélèvement.
- LCR : volume minimum 1 ml
*Conditions de centrifugation : 800 à 1600 g/min pendant 20 minutes à température ambiante
Conditions de transport : Acheminement du prélèvement (plasma/LCR) < à - 20° C
Observations particulières :
- Préciser le traitement antirétroviral et le nom du prescripteur (si patient non suivi dans NADIS)
- Fournir le dernier résultat de la charge virale VIH-1 (< 1 mois, sinon sera réalisée et facturée en plus)
- Analyse réalisable uniquement pour une charge virale > 200 copies/mL.
Le génotypage de résistance sera tenté pour les charges virales comprises entre 100 - 199 copies/mL, cependant le risque d'échec de séquençage est plus élevé.
- Le choix de la technique utilisée est dépendant de la valeur de la charge virale VIH-1 : NGS pour les charges > 500 copies/mL, Séquençage capillaire pour les charges comprises entre 200 et 500 copies/mL (et en cas d'échec avec la technique NGS)
- Pour toute demande sur LCR, la détermination du tropisme du VIH-1 est impérativement réalisée et facturée en plus.
Documents associés
Techniques / informations pratiques
Méthode : Séquençage à haut débit NGS ou séquençage capillaire (selon la charge virale)
Fréquence de réalisation : 1 x/ 2 semaines
Urgence (O/N) : Non
Délai moyen de rendu de résultats : 4 semaines
Fréquence de réalisation : 1 x/ 2 semaines
Urgence (O/N) : Non
Délai moyen de rendu de résultats : 4 semaines
Interlocuteurs
Laboratoire exécutant : Virologie
Heures d'ouvertures : 8h-17h30
Praticiens :
Dr Laurence BOCKET
Dr Kazali ALIDJINOU
Dr Aurélie GUIGON
Dr Pauline COULON
03 20 44 69 30 (Secrétariat)
laurence.bocket@chu-lille.fr
enagnonkazali.alidjinou@chu-lille.fr
aurelie.guigon@chu-lille.fr
pauline.coulon@chu-lille.fr
Heures d'ouvertures : 8h-17h30
Praticiens :
Dr Laurence BOCKET
Dr Kazali ALIDJINOU
Dr Aurélie GUIGON
Dr Pauline COULON
03 20 44 69 30 (Secrétariat)
laurence.bocket@chu-lille.fr
enagnonkazali.alidjinou@chu-lille.fr
aurelie.guigon@chu-lille.fr
pauline.coulon@chu-lille.fr
Tarification
Cotation :
B 1300
Identifiant (NABM ou HN) :
0805
Libellé(s) NABM ou HN (RIHN ou LC) :
VIH : Test de résistance génotypique aux antirétroviraux par séquençage du
- gène de la transcriptase inverse (inhibiteurs de la transcriptase inverse)
- gène de la protéase virale (inhibiteurs de protéases)
- et du gène de l'intégrase (inhibiteurs de l'intégrase)
B 1300
Identifiant (NABM ou HN) :
0805
Libellé(s) NABM ou HN (RIHN ou LC) :
VIH : Test de résistance génotypique aux antirétroviraux par séquençage du
- gène de la transcriptase inverse (inhibiteurs de la transcriptase inverse)
- gène de la protéase virale (inhibiteurs de protéases)
- et du gène de l'intégrase (inhibiteurs de l'intégrase)
En savoir plus
Le VIH présente une grande variabilité génétique, avec plusieurs espèces virales (VIH1 et VIH2, mais aussi au sein de chacune de ces espèces de nombreux sous-types différents), et chez un même individu l'existence de variants dont certains sont responsables de résistance aux traitements disponibles. Ces variants peuvent émerger lors de la thérapeutique mais aussi être transmis (environ 10 % de résistance transmise en France).
Pour les patients infectés par le VIH2, le suivi virologique est centralisé dans une cohorte nationale au laboratoire de virologie de l'hôpital Bichat-Claude Bernard. Le laboratoire de virologie du CHRU de Lille n'effectue que les examens de suivi des patients infectés par le VIH1, mais centralise les échantillons des patients VIH2 pour envoi à Bichat. Lire la suite
Pour les patients infectés par le VIH2, le suivi virologique est centralisé dans une cohorte nationale au laboratoire de virologie de l'hôpital Bichat-Claude Bernard. Le laboratoire de virologie du CHRU de Lille n'effectue que les examens de suivi des patients infectés par le VIH1, mais centralise les échantillons des patients VIH2 pour envoi à Bichat. Lire la suite
Historique
| Date | Donnée | Ancienne valeur | Nouvelle valeur |
|---|---|---|---|
| 17/07/2023 12:35:13 | Cotation | B 1 |
B 1300 |
| 17/07/2023 12:35:13 | Délai moyen de rendu de résultats | 4 semaines | |
| 10/11/2023 15:21:28 | SIL-FE-CBP-200 V3 |
Les informations ci-dessus vous permettent de connaître dans quel secteur l'analyse est réalisée, avec quelle méthode, quel délai (hors examens complémentaires ou associés), à quel coût, etc ...